De doelstelling van het ziekenhuis is medisch specialistische zorg te bieden aan patiënten in het verzorgingsgebied en ook daarbuiten als het om bijzondere functies gaat. Afgeleide doelen zijn opleiding en wetenschappelijk onderzoek.

Het Slotervaartziekenhuis gaat uit van de integriteit van het individu, het zelfbeschikkingsrecht en het sociale grondrecht op optimale gezondheidszorg. Het ziekenhuis stelt de mens in zijn totaliteit centraal met al zijn persoonlijke, culturele en levensbeschouwelijke wortels.